RNAcompete results for RNCMPT01687 / RBM38.S.dr (Species:Danio_rerio)

Motif


7-mer scatter plot


Top 7-mers by Z-score

Set A

score

Set B

score

Set A+B

score
GAGUGAA 6.41 AGAGUGU 5.63 AGAGUGU 5.97
AGAGUGA 5.69 GAGUGUG 5.34 GAGUGAA 5.81
AGAGUGU 5.53 GAGUGUU 5.34 AGAGUGA 5.47
GAGUGUU 4.71 AGUGUGA 5.31 GAGUGUU 5.37
AGUGUUU 4.68 UUGUGUU 5.03 AGUGUGA 5.10
UGUGUGU 4.67 UUUUGUG 4.73 GAGUGUG 4.98
UGUGUGA 4.61 UUUGUGU 4.64 UGUGUGA 4.90
GUGUGUA 4.58 UGUGUUU 4.57 UGUGUGU 4.77
AGUGUGU 4.58 AGAGUGA 4.56 UUGUGUG 4.73
GUGUGAA 4.57 UGUGUGA 4.55 GAGUGUA 4.53

Aligned top 7-mers

Set A

Set B

All data
-GAGUGAA AGAGUGU-- AGAGUGU--
AGAGUGA- -GAGUGUG- -GAGUGAA-
AGAGUGU- -GAGUGUU- --AGAGUGA
-GAGUGUU --AGUGUGA -GAGUGUU-
AGUGUUU- -UUGUGUU- --AGUGUGA
UGUGUGU- -UUUUGUG- -GAGUGUG-
UGUGUGA- --UUUGUGU --UGUGUGA
-GUGUGUA --UGUGUUU --UGUGUGU
AGUGUGU- --AGAGUGA -UUGUGUG-
-GUGUGAA --UGUGUGA -GAGUGUA-

generated on Tue Aug 9 21:21:25 EDT 2022