RNAcompete results for RNCMPT01680 / srsf3.xt (Species:Xenopus_tropicalis)

Motif


7-mer scatter plot


Top 7-mers by Z-score

Set A

score

Set B

score

Set A+B

score

CAACAAC 12.08 ACAACGA 10.53 CAACAAC 11.14
ACAACAA 11.66 AUCAACG 10.03 ACAACAA 10.97
ACGACGA 11.33 CAACAAC 9.81 AUCAACG 10.43
AACAACA 10.39 AACAACG 9.71 AACAACA 9.94
AUCAACG 10.35 ACAACAA 9.68 AACAACG 9.82
AACAACG 9.49 CAACGAC 9.54 ACAACGA 9.81
GACAACA 8.87 UCAACGA 9.29 ACGACGA 9.60
ACAACAG 8.69 CAACGAG 8.99 CAACGAC 8.72
AUCAACA 8.57 AACAACA 8.88 ACAACAG 8.53
AGACAAC 8.49 ACGACAA 8.58 AUCAACA 8.40

Aligned top 7-mers

Set A

Set B

All data

CAACAAC-- -ACAACGA- CAACAAC--
--ACAACAA AUCAACG-- --ACAACAA
--ACGACGA --CAACAAC -AUCAACG-
-AACAACA- AACAACG-- -AACAACA-
-AUCAACG- -ACAACAA- -AACAACG-
-AACAACG- --CAACGAC --ACAACGA
-GACAACA- -UCAACGA- --ACGACGA
--ACAACAG --CAACGAG CAACGAC--
-AUCAACA- AACAACA-- --ACAACAG
AGACAAC-- -ACGACAA- -AUCAACA-

generated on Tue Aug 9 21:21:06 EDT 2022