RNAcompete results for RNCMPT00791 / PK20656.1 (Species:Cannabis_sativa)

Motif


7-mer scatter plot


Top 7-mers by Z-score

Set A

score

Set B

score

Set A+B

score

ACGACGA 7.63 ACUACGA 6.45 ACUACGA 6.44
ACUACGA 5.99 ACACUAC 6.25 ACACUAC 6.30
ACACUAC 5.89 ACAACGA 5.96 ACGACGA 5.89
AUACGAC 5.64 CAACAAC 5.72 ACAACGA 5.79
ACUACAC 5.61 CAACUAC 5.58 AUACGAC 5.76
ACUACAA 5.46 AUACGAC 5.36 CUACUAC 5.32
CUACUAC 5.36 ACUACCU 5.35 UACGACG 5.30
UACGACG 5.35 CUACGAC 5.04 CAACAAC 5.20
AUACUAC 5.29 CUACUAC 4.96 AUACUAC 5.15
ACAACGA 5.23 UACGACG 4.93 ACGACAA 5.15

Aligned top 7-mers

Set A

Set B

All data

--ACGACGA-- ACUACGA--- --ACUACGA--
--ACUACGA-- -ACACUAC-- ACACUAC----
ACACUAC---- ACAACGA--- --ACGACGA--
---AUACGAC- -CAACAAC-- --ACAACGA--
--ACUACAC-- -CAACUAC-- ---AUACGAC-
--ACUACAA-- -AUACGAC-- ---CUACUAC-
---CUACUAC- ---ACUACCU ----UACGACG
----UACGACG -CUACGAC-- ---CAACAAC-
AUACUAC---- -CUACUAC-- AUACUAC----
--ACAACGA-- --UACGACG- --ACGACAA--

generated on Thu Aug 11 07:59:57 EDT 2022