RNAcompete results for RNCMPT00763 / LmjF30.1110 (Species:Leishmania_major)

Motif


7-mer scatter plot


Top 7-mers by Z-score

Set A

score

Set B

score

Set A+B

score

GAUGAUG 12.58 AUGAAUG 12.49 AAUGAUG 12.25
AUGAUGA 12.39 AAUGAUG 11.44 AUGAUGA 12.22
AAUGAUG 12.24 AUGAUGA 11.20 AUGAAUG 11.38
AUGUAUG 11.35 AUGUAUG 10.55 GAUGAUG 11.37
AUGAUGC 10.99 GAUGAUG 9.51 AUGUAUG 11.22
AUGAUGU 10.91 AGAUGAU 9.10 AUGAUGU 10.38
UAUGAUG 9.84 AUGAUGU 9.09 AUGAUGC 10.05
AGAUGAU 9.76 AUGAUGC 8.67 AGAUGAU 9.73
AUGAUGG 9.68 GAAUGAU 8.62 UAUGAUG 9.40
AUGAAUG 9.63 AGAUGUU 8.51 AGAUGAA 9.23

Aligned top 7-mers

Set A

Set B

All data

-GAUGAUG- -AUGAAUG-- -AAUGAUG-
--AUGAUGA -AAUGAUG-- --AUGAUGA
-AAUGAUG- --AUGAUGA- --AUGAAUG
--AUGUAUG -AUGUAUG-- -GAUGAUG-
--AUGAUGC -GAUGAUG-- -AUGUAUG-
--AUGAUGU AGAUGAU--- --AUGAUGU
-UAUGAUG- --AUGAUGU- --AUGAUGC
AGAUGAU-- --AUGAUGC- AGAUGAU--
--AUGAUGG GAAUGAU--- -UAUGAUG-
--AUGAAUG ---AGAUGUU AGAUGAA--

generated on Thu Aug 11 07:59:00 EDT 2022