RNAcompete results for RNCMPT00678 / estExt_fgenesh1_pm.C_10202 (Species:Other)

Motif


7-mer scatter plot


Top 7-mers by Z-score

Set A

score

Set B

score

Set A+B

score

AACUACU 15.39 CAACUAA 16.51 AACUACA 14.52
AACUACA 15.18 AACUACG 13.67 GAACUAC 14.42
GAACUAA 14.56 CAACUAC 13.56 GAACUAA 14.04
GAACUAC 14.53 GAACUAC 13.49 CAACUAA 13.83
CUAACUA 14.19 CCAACUA 13.43 AACUAAC 13.80
AACUAAC 14.06 AACUACA 13.29 CUAACUA 13.32
UAACUAC 13.59 AACUAAU 13.16 CAACUAC 13.28
AACUAAG 13.55 AACUAAC 12.99 AACUACU 13.17
ACUACUA 12.79 GAACUAA 12.70 AACUACG 13.05
UAACUAA 12.40 CUAACUA 12.09 UAACUAC 12.80

Aligned top 7-mers

Set A

Set B

All data

--AACUACU- -CAACUAA- --AACUACA
--AACUACA- --AACUACG -GAACUAC-
-GAACUAA-- -CAACUAC- -GAACUAA-
-GAACUAC-- -GAACUAC- -CAACUAA-
CUAACUA--- CCAACUA-- --AACUAAC
--AACUAAC- --AACUACA CUAACUA--
-UAACUAC-- --AACUAAU -CAACUAC-
--AACUAAG- --AACUAAC --AACUACU
---ACUACUA -GAACUAA- --AACUACG
-UAACUAA-- CUAACUA-- -UAACUAC-

generated on Thu Aug 11 07:56:09 EDT 2022