RNAcompete results for RNCMPT00478 / PK01594.1 (Species:Cannabis_sativa)

Motif


7-mer scatter plot


Top 7-mers by Z-score

Set A

score

Set B

score

Set A+B

score

AUAUGUG 7.76 UAUUGUG 10.13 UAUUGUG 8.72
AUAUUGU 7.71 AAUUGUU 8.44 AUAUUGU 7.52
UAUAUUG 7.71 AUAAUUG 8.26 AUAUUUG 7.42
UAUAUGU 7.68 AAUUGUG 7.44 AAUUGUU 7.29
AUAUUUG 7.42 AAAUUGU 7.39 AUAUGUG 7.19
UAUUGUG 7.20 AAUUGUA 7.08 UUAUUGU 7.15
UAUUUGU 6.97 UUAUUGU 7.01 UAUUUGU 7.10
UUAUUGU 6.70 AUUGUGA 6.88 AUAAUUG 7.09
UUGUGUA 6.62 AUAUUGU 6.88 AAAUUGU 6.93
AUUGUUG 6.53 AUUUGUG 6.84 UAUAUGU 6.88

Aligned top 7-mers

Set A

Set B

All data

-AUAUGUG-- --UAUUGUG- -UAUUGUG-
-AUAUUGU-- --AAUUGUU- -AUAUUGU-
UAUAUUG--- AUAAUUG--- AUAUUUG--
UAUAUGU--- --AAUUGUG- --AAUUGUU
-AUAUUUG-- -AAAUUGU-- --AUAUGUG
--UAUUGUG- --AAUUGUA- -UUAUUGU-
-UAUUUGU-- -UUAUUGU-- -UAUUUGU-
-UUAUUGU-- ---AUUGUGA AUAAUUG--
--UUGUGUA- -AUAUUGU-- -AAAUUGU-
---AUUGUUG --AUUUGUG- -UAUAUGU-

generated on Wed Aug 10 04:03:33 EDT 2022