RNAcompete results for RNCMPT00394 / ENSMGAG00000012226 (Species:Meleagris_gallopavo)

Motif


7-mer scatter plot


Top 7-mers by Z-score

Set A

score

Set B

score

Set A+B

score

AGAUGAA 11.43 AGAUGAA 10.31 AGAUGAA 11.29
AUGAUUA 10.67 AUGAUUA 9.24 AUGAUUA 10.41
GAUGAAA 9.55 AGAUCAA 9.00 GAUGAUU 9.37
GAUGAUU 9.52 AAAUUAG 8.70 GAUGAAA 9.19
AAUGAUU 9.51 GAUGAUU 8.60 AAUGAUU 8.50
AUGAUUG 8.85 GAUGAAU 8.50 AGAUUAG 8.40
AAAUUAA 8.34 AGAUUAG 8.22 AGAUGAU 8.18
UAAUGAA 8.24 GAAUGAA 8.20 AGAUUAA 8.17
AUGAUAA 8.16 GAUCAAA 8.17 AAAUUAG 8.16
AGAUUAA 8.12 UGAUGAU 8.02 AGAUCAA 8.07

Aligned top 7-mers

Set A

Set B

All data

--AGAUGAA- AGAUGAA-- AGAUGAA--
-AUGAUUA-- --AUGAUUA --AUGAUUA
---GAUGAAA AGAUCAA-- -GAUGAUU-
GAUGAUU--- AAAUUAG-- -GAUGAAA-
AAUGAUU--- -GAUGAUU- -AAUGAUU-
-AUGAUUG-- -GAUGAAU- AGAUUAG--
--AAAUUAA- AGAUUAG-- AGAUGAU--
--UAAUGAA- GAAUGAA-- AGAUUAA--
-AUGAUAA-- -GAUCAAA- AAAUUAG--
--AGAUUAA- UGAUGAU-- AGAUCAA--

generated on Wed Aug 10 04:00:50 EDT 2022