RNAcompete results for RNCMPT00342 / PK27672.1 (Species:Cannabis_sativa)

Motif


7-mer scatter plot


Top 7-mers by Z-score

Set A

score

Set B

score

Set A+B

score

AGUACAA 12.11 AAGUACA 12.17 AGUACAA 12.00
AGUACAG 10.92 AGUACAA 11.33 AAGUACA 11.73
AAGUACA 10.41 CAAGUAC 10.00 AGUACAG 10.22
ACGUACA 10.28 AAAGUAC 9.74 ACGUACA 9.89
UAGUACA 10.23 ACAGUAC 9.50 CAGUACA 9.29
AGUACAU 8.94 CAGUACA 9.38 AGUACAU 9.27
CAGUACA 8.54 AGUACAG 9.10 GUACAAA 9.03
GUACAAA 8.46 AGUACAU 9.05 ACAGUAC 8.94
GUACAAG 8.01 GUACAAA 9.04 GUACAAG 8.76
CGUACAA 7.93 GUACAAG 8.91 AAAGUAC 8.73

Aligned top 7-mers

Set A

Set B

All data

-AGUACAA- -AAGUACA-- --AGUACAA-
-AGUACAG- --AGUACAA- -AAGUACA--
AAGUACA-- CAAGUAC--- --AGUACAG-
ACGUACA-- AAAGUAC--- -ACGUACA--
UAGUACA-- ACAGUAC--- -CAGUACA--
-AGUACAU- -CAGUACA-- --AGUACAU-
CAGUACA-- --AGUACAG- ---GUACAAA
--GUACAAA --AGUACAU- ACAGUAC---
--GUACAAG ---GUACAAA ---GUACAAG
-CGUACAA- ---GUACAAG AAAGUAC---

generated on Wed Aug 10 03:59:10 EDT 2022