6AA = * 15AA = ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ * * ^ ^ * * * Alx3 RRN...R.T....T....F.....S..T.F.Q.......LE..E.......L...E...............K...V..FQ.......................K...T...HY....P...DVYAREQL...ALRT..........................................................DLTEA..........R.................V..........Q..........VW.F....Q.................N..R..................R.....A....K..WRK. Bapx1 KRS...R.A....A....F.....S..H.A.Q.......VF..E.......L...E...............R...R..FN.......................H...Q...RY....L...SGPERADL...AASL..........................................................KLTET..........Q.................V..........K..........IW.F....Q.................N..R..................R.....Y....K..TKR. Barhl1 RKA...R.T....A....F.....T..D.H.Q.......LA..Q.......L...E...............R...S..FE.......................R...Q...KY....L...SVQDRMEL...AASL..........................................................NLTDT..........Q.................V..........K..........TW.Y....Q.................N..R..................R.....T....K..WKR. Barx1 RRS...R.T....V....F.....T..E.L.Q.......LM..G.......L...E...............K...R..FE.......................K...Q...KY....L...STPDRIDL...AESL..........................................................GLSQL..........Q.................V..........K..........TW.Y....Q.................N..R..................R.....M....K..WKK. Bsx RKA...R.T....V....F.....S..D.S.Q.......LS..G.......L...E...............K...R..FE.......................I...Q...RY....L...STPERVEL...ATAL..........................................................SLSET..........Q.................V..........K..........TW.F....Q.................N..R..................R.....M....K..HKK. Cdx1 DKY...R.V....V....Y.....T..D.H.Q.......RL..E.......L...E...............K...E..FH.......................Y...S...RY....I...TIRRKSEL...AANL..........................................................GLTER..........Q.................V..........K..........IW.F....Q.................N..R..................R.....A....K..ERK. Cphx SKP...R.H....K....F.....S..R.D.E.......LK..R.......L...K...............Q...E..FA.......................Y...A...PY....P...DFTTKDEL...ARQF..........................................................QCEVS..........V.................I..........D..........NW.F....Q.................N..K..................R.....A....R..LAP. Crx RRE...R.T....T....F.....T..R.S.Q.......LE..E.......L...E...............A...L..FA.......................K...T...QY....P...DVYAREEV...ALKI..........................................................NLPES..........R.................V..........Q..........VW.F....K.................N..R..................R.....A....K..CRQ. Cutl1 KKP...R.V....V....L.....A..P.E.E.......KE..A.......L...K...............R...A..YQ.......................Q...K...PY....P...SPKTIEEL...ATQL..........................................................NLKTS..........T.................V..........I..........NW.F....H.................N..Y..................R.....S....R..IRR. Dbx1 MLR...R.A....V....F.....S..D.V.Q.......RK..A.......L...E...............K...T..FQ.......................K...Q...KY....I...SKPDRKKL...ASKL..........................................................GLKDS..........Q.................V..........K..........IW.F....Q.................N..R..................R.....M....K..WRN. Dlx1 RKP...R.T....I....Y.....S..S.L.Q.......LQ..A.......L...N...............R...R..FQ.......................Q...T...QY....L...ALPERAEL...AASL..........................................................GLTQT..........Q.................V..........K..........IW.F....Q.................N..K..................R.....S....K..FKK. Dobox4 RKK...R.N....M....P.....S..I.E.Q.......KL..V.......L...K...............E...H..FD.......................E...S...KY....L...NKEQCKSL...AQKL..........................................................GMKEK..........Q.................I..........K..........TH.F....K.................N..K..................R.....A....R..ERR. Dobox5 RKQ...H.T....V....Y.....S..K.E.Q.......QH..L.......L...K...............E...H..FK.......................E...C...QY....P...NEKKIVEL...AVLV..........................................................GVTKM..........E.................I..........K..........IW.M....N.................L..Q..................N.....I....K..QAL. Duxl RRS...R.T....H....F.....T..K.F.Q.......TD..I.......L...I...............E...A..FE.......................K...N...RF....P...GIVTREKL...AQQT..........................................................GIPES..........R.................I..........H..........IW.F....Q.................N..R..................R.....A....R..HPD. Emx2 KRI...R.T....A....F.....S..P.S.Q.......LL..R.......L...E...............H...A..FE.......................K...N...HY....V...VGAERKQL...AHSL..........................................................SLTET..........Q.................V..........K..........VW.F....Q.................N..R..................R.....T....K..FKR. En1 KRP...R.T....A....F.....T..A.E.Q.......LQ..R.......L...K...............A...E..FQ.......................A...N...RY....I...TEQRRQTL...AQEL..........................................................SLNES..........Q.................I..........K..........IW.F....Q.................N..K..................R.....A....K..IKK. Esx1 RRY...R.I....C....F.....T..P.I.Q.......LQ..E.......L...E...............A...F..FQ.......................R...V...QY....P...DLFARVEL...ARRL..........................................................GLPEP..........R.................V..........Q..........VW.F....Q.................N..R..................R.....A....K..WRR. Evx1 RRY...R.T....A....F.....T..R.E.Q.......IA..R.......L...E...............K...E..FY.......................R...E...NY....V...SRPRRCEL...AAAL..........................................................NLPET..........T.................I..........K..........VW.F....Q.................N..R..................R.....M....K..DKR. Gsc RRH...R.T....I....F.....T..D.E.Q.......LE..A.......L...E...............N...L..FQ.......................E...T...KY....P...DVGTREQL...ARKV..........................................................HLREE..........K.................V..........E..........VW.F....K.................N..R..................R.....A....K..WRR. Gsh2 KRM...R.T....A....F.....T..S.T.Q.......LL..E.......L...E...............R...E..FS.......................S...N...MY....L...SRLRRIEI...ATYL..........................................................NLSEK..........Q.................V..........K..........IW.F....Q.................N..R..................R.....V....K..HKK. Hdx KRAlqdR.T....Q....F.....S..D.R.D.......LA..T.......L...K...............K...Y..WD.......................N...G...MTslgsV...CREKIEAV...AIEL..........................................................NVDCE..........I.................V..........R..........TW.I....G.................N..R..................R.....R....K..YRL. Hlx1 SWS...R.A....V....F.....S..N.L.Q.......RK..G.......L...E...............K...R..FE.......................I...Q...KY....V...TKPDRKQL...AAML..........................................................GLTDA..........Q.................V..........K..........VW.F....Q.................N..R..................R.....M....K..WRH. Hlxb9 RRP...R.T....A....F.....T..S.Q.Q.......LL..E.......L...E...............H...Q..FK.......................L...N...KY....L...SRPKRFEV...ATSL..........................................................MLTET..........Q.................V..........K..........IW.F....Q.................N..R..................R.....M....K..WKR. Hmbox1 RGS...R.F....T....W.....R..K.E.C.......LA..V.......M...E...............S...Y..FN.......................E...N...QY....P...DEAKREEI...ANACnaviqkp...........................................gkklsdleRVTSL..........K.................V..........Y..........NW.F....A.................N..R..................R.....K....E..IKR. Hmx1 KKT...R.T....V....F.....S..R.S.Q.......VF..Q.......L...E...............S...T..FD.......................L...K...RY....L...SSAERAGL...AASL..........................................................QLTET..........Q.................V..........K..........IW.F....Q.................N..R..................R.....N....K..WKR. Hmx2 KKT...R.T....V....F.....S..R.S.Q.......VY..Q.......L...E...............S...T..FD.......................M...K...RY....L...SSSERACL...ASSL..........................................................QLTET..........Q.................V..........K..........TW.F....Q.................N..R..................R.....N....K..WKR. Homez KTK...R.-....-....K.....T..K.E.Q.......LA..I.......L...K...............S...F..FL.......................Q...C...QW....A...RREDYHKL...EQIT..........................................................GLPRP..........E.................I..........I..........QW.F....G.................D..T..................R.....Y....A..LKH. Hoxa1 NAV...R.T....N....F.....T..T.K.Q.......LT..E.......L...E...............K...E..FH.......................F...N...KY....L...TRARRVEI...AASL..........................................................QLNET..........Q.................V..........K..........IW.F....Q.................N..R..................R.....M....K..QKK. Hoxa10 RKK...R.C....P....Y.....T..K.H.Q.......TL..E.......L...E...............K...E..FL.......................F...N...MY....L...TRERRLEI...SRSV..........................................................HLTDR..........Q.................V..........K..........IW.F....Q.................N..R..................R.....M....K..LKK. Hoxa13 RKK...R.V....P....Y.....T..K.V.Q.......LK..E.......L...E...............R...E..YA.......................T...N...KF....I...TKDKRRRI...SATT..........................................................NLSER..........Q.................V..........T..........IW.F....Q.................N..R..................R.....V....K..EKK. Hoxa2 RRL...R.T....A....Y.....T..N.T.Q.......LL..E.......L...E...............K...E..FH.......................F...N...KY....L...CRPRRVEI...AALL..........................................................DLTER..........Q.................V..........K..........VW.F....Q.................N..R..................R.....M....K..HKR. Hoxa6 RRG...R.Q....T....Y.....T..R.Y.Q.......TL..E.......L...E...............K...E..FH.......................F...N...RY....L...TRRRRIEI...ANAL..........................................................CLTER..........Q.................I..........K..........IW.F....Q.................N..R..................R.....M....K..WKK. Hoxb13 RKK...R.I....P....Y.....S..K.G.Q.......LR..E.......L...E...............R...E..YA.......................A...N...KF....I...TKDKRRKI...SAAT..........................................................SLSER..........Q.................I..........T..........IW.F....Q.................N..R..................R.....V....K..EKK. Hoxc12 RKK...R.K....P....Y.....S..K.L.Q.......LA..E.......L...E...............G...E..FL.......................V...N...EF....I...TRQRRREL...SDRL..........................................................NLSDQ..........Q.................V..........K..........IW.F....Q.................N..R..................R.....M....K..KKR. Hoxc8 RSG...R.Q....T....Y.....S..R.Y.Q.......TL..E.......L...E...............K...E..FL.......................F...N...PY....L...TRKRRIEV...SHAL..........................................................GLTER..........Q.................V..........K..........IW.F....Q.................N..R..................R.....M....K..WKK. Ipf1 KRT...R.T....A....Y.....T..R.A.Q.......LL..E.......L...E...............K...E..FL.......................F...N...KY....I...SRPRRVEL...AVML..........................................................NLTER..........H.................I..........K..........IW.F....Q.................N..R..................R.....M....K..WKK. Irx2 PAY...R.K....N....A.....T..R.D.A.......TA..T.......L...K...............AwlnE..HR.......................K...N...PY....P...TKGEKIML...AIIT..........................................................KMTLT..........Q.................V..........S..........TW.F....A.................N..A..................R.....R....R..LKK. Irx3 PKN...A.T....R....E.....S..T.S.T.......LK..A.......W...L...............N...E..HR.......................K...N...PY....P...TKGEKIML...AIIT..........................................................KMTLT..........Q.................V..........S..........TW.F....A.................N..A..................R.....R....R..LKK. Isl2 TRV...R.T....V....L.....N..E.K.Q.......LH..T.......L...R...............T...C..YA.......................A...N...PR....P...DALMKEQL...VEMT..........................................................GLSPR..........V.................I..........R..........VW.F....Q.................N..K..................R.....C....K..DKK. Isx RRV...R.T....T....F.....T..T.E.Q.......LQ..E.......L...E...............K...L..FH.......................F...T...HY....P...DIHVRSQL...ASRI..........................................................NLPEA..........R.................V..........Q..........IW.F....Q.................N..Q..................R.....A....K..WRK. Lbx2 RKS...R.T....A....F.....T..A.Q.Q.......VL..E.......L...E...............R...R..FV.......................F...Q...KY....L...APSERDGL...AARL..........................................................GLANA..........Q.................V..........V..........TW.F....Q.................N..R..................R.....A....K..LKR. Lhx1 RGP...R.T....T....I.....K..A.K.Q.......LE..T.......L...K...............A...A..FA.......................A...T...PK....P...TRHIREQL...AQET..........................................................GLNMR..........V.................I..........Q..........VW.F....Q.................N..R..................R.....S....K..ERR. Lhx2 KRM...R.T....S....F.....K..H.H.Q.......LR..T.......M...K...............S...Y..FA.......................I...N...HN....P...DAKDLKQL...AQKT..........................................................GLTKR..........V.................L..........Q..........VW.F....Q.................N..A..................R.....A....K..FRR. Lhx3 KRP...R.T....T....I.....T..A.K.Q.......LE..T.......L...K...............S...A..YN.......................T...S...PK....P...ARHVREQL...SSET..........................................................GLDMR..........V.................V..........Q..........VW.F....Q.................N..R..................R.....A....K..EKR. Lhx6 KRA...R.T....S....F.....T..A.E.Q.......LQ..V.......M...Q...............A...Q..FA.......................Q...D...NN....P...DAQTLQKL...ADMT..........................................................GLSRR..........V.................I..........Q..........VW.F....Q.................N..C..................R.....A....R..HKK. Meis1 HKK...R.G....I....F.....P..K.V.A.......TN..I.......M...R...............A..wL..FQ.......................Hl.tH...PY....P...SEEQKKQL...AQDT..........................................................GLTIL..........Q.................V..........N..........NW.F....I.................N..A..................R.....R....R..IVQ. Meox1 RKE...R.T....A....F.....T..K.E.Q.......LR..E.......L...E...............A...E..FA.......................H...H...NY....L...TRLRRYEI...AVNL..........................................................DLSER..........Q.................V..........K..........VW.F....Q.................N..R..................R.....M....K..WKR. Msx1 RKP...R.T....P....F.....T..T.A.Q.......LL..A.......L...E...............R...K..FR.......................Q...K...QY....L...SIAERAEF...SSSL..........................................................SLTET..........Q.................V..........K..........IW.F....Q.................N..R..................R.....A....K..AKR. Nkx1-1 RRA...R.T....A....F.....T..Y.E.Q.......LV..A.......L...E...............N...K..FK.......................A...T...RY....L...SVCERLNL...ALSL..........................................................SLTET..........Q.................V..........K..........IW.F....Q.................N..R..................R.....T....K..WKK. Nkx2-2 RKR...R.V....L....F.....S..K.A.Q.......TY..E.......L...E...............R...R..FR.......................Q...Q...RY....L...SAPEREHL...ASLI..........................................................RLTPT..........Q.................V..........K..........IW.F....Q.................N..H..................R.....Y....K..MKR. Nkx6-1 KHT...R.P....T....F.....S..G.Q.Q.......IF..A.......L...E...............K...T..FE.......................Q...T...KY....L...AGPERARL...AYSL..........................................................GMTES..........Q.................V..........K..........VW.F....Q.................N..R..................R.....T....K..WRK. Obox1 RKE...R.T....V....Y.....T..K.E.Q.......QG..L.......L...Q...............K...H..FD.......................E...C...QY....P...NKKKIVEL...ALSV..........................................................GVTKR..........E.................I..........K..........IW.F....K.................N..N..................R.....A....K..YRR. Obox6 RKI...R.T....V....Y.....T..E.E.Q.......KC..V.......L...K...............K...H..FH.......................K...C...TY....P...SREQRMAL...AVLV..........................................................GVTAN..........E.................I..........Q..........IW.F....K.................N..H..................R.....A....K..SKR. Og2x KKT...R.T....L....Y.....R..S.D.Q.......LE..E.......L...E...............R...I..FQ.......................E...D...HY....P...DSDKRHEI...SQMV..........................................................GVTPQ..........R.................I..........M..........VW.F....Q.................N..R..................R.....A....K..WRK. Otp KRH...R.T....R....F.....T..P.A.Q.......LN..E.......L...E...............R...S..FA.......................K...T...HY....P...DIFMREEL...ALRI..........................................................GLTES..........R.................V..........Q..........VW.F....Q.................N..R..................R.....A....K..WKK. Pax4 HRN...R.T....I....F.....S..P.G.Q.......AE..A.......L...E...............K...E..FQ.......................R...G...QY....P...DSVARGKL...AAAT..........................................................SLPED..........T.................V..........R..........VW.F....S.................N..R..................R.....A....K..WRR. Pax6 QRN...R.T....S....F.....T..Q.E.Q.......IE..A.......L...E...............K...E..FE.......................R...T...HY....P...DVFARERL...AAKI..........................................................DLPEA..........R.................I..........Q..........VW.F....S.................N..R..................R.....A....K..WRR. Pax7 RRS...R.T....T....F.....T..A.E.Q.......LE..E.......L...E...............K...A..FE.......................R...T...HY....P...DIYTREEL...AQRT..........................................................KLTEA..........R.................V..........Q..........VW.F....S.................N..R..................R.....A....R..WRK. Pbx1 RRK...R.R....N....F.....N..K.Q.A.......TE..I.......L...N...............E...Y..FYs....................hlS...N...PY....P...SEEAKEEL...AKKC..........................................................GITVS..........Q.................V..........S..........NW.F....G.................N..K..................R.....I....R..YKK. Pitx1 RRQ...R.T....H....F.....T..S.Q.Q.......LQ..E.......L...E...............A...T..FQ.......................R...N...RY....P...DMSMREEI...AVWT..........................................................NLTEP..........R.................V..........R..........VW.F....K.................N..R..................R.....A....K..WRK. Pknox1 KNK...R.G....V....L.....P..K.H.A.......TN..V.......M...R...............S..wL..FQ.......................Hi.gH...PY....P...TEDEKKQI...AAQT..........................................................NLTLL..........Q.................V..........N..........NW.F....I.................N..A..................R.....R....R..ILQ. Pou1f1 RKR...R.T....T....I.....S..V.A.A.......KD..A.......L...E...............R...H..FG.......................E...H...SK....P...SSQEIMRM...AEEL..........................................................NLEKE..........V.................V..........R..........VW.F....C.................N..R..................R.....Q....R..EKR. Pou2f1 RKK...R.T....S....I.....E..T.N.I.......RV..A.......L...E...............K...S..FM.......................E...N...QK....P...TSEDITLI...AEQL..........................................................NMEKE..........V.................I..........R..........VW.F....C.................N..R..................R.....Q....K..EKR. Pou4f3 KRK...R.T....S....I.....A..A.P.E.......KR..S.......L...E...............A...Y..FA.......................I...Q...PR....P...SSEKIAAI...AEKL..........................................................DLKKN..........V.................V..........R..........VW.F....C.................N..Q..................R.....Q....K..QKR. Pou6f1 RKR...R.T....S....F.....T..P.Q.A.......IE..A.......L...N...............A...Y..FE.......................K...N...PL....P...TGQEITEI...AKEL..........................................................NYDRE..........V.................V..........R..........VW.F....C.................N..R..................R.....Q....T..LKN. Rhox11 RKA...Y.-....R....F.....T..P.G.Q.......LW..E.......L...Q...............A...V..FV.......................E...N...QY....P...DALKRKEL...AGLL..........................................................NVDEQ..........K.................I..........K..........DW.F....N.................N..K..................R.....A....K..YRK. Rhox6 RYR...R.T....R....F.....T..H.S.Q.......LH..D.......L...E...............R...L..FQ.......................E...T...RY....P...SLRARRDL...ARWM..........................................................GVDEC..........D.................V..........Q..........NW.F....R.................M..R..................R.....A....L..FQR. Six1 ETS...Y.-....C....F.....K..E.K.S.......RG..V.......L...R...............E...W..YA.......................H...N...PY....P...SPREKREL...AEAT..........................................................GLTTT..........Q.................V..........S..........NW.F....K.................N..R..................R.....Q....R..DRA. Six3 EQK...T.H....C....F.....K..E.R.T.......RS..L.......L...R...............E...W..YL.......................Q...D...PY....P...NPSKKREL...AQAT..........................................................GLTPT..........Q.................V..........G..........NW.F....K.................N..R..................R.....Q....R..DRA. Six4 EET...V.Y....C....F.....K..E.K.S.......RN..A.......L...K...............E...L..YK.......................Q...N...RY....P...SPAEKRHL...AKIT..........................................................GLSLT..........Q.................V..........S..........NW.F....K.................N..R..................R.....Q....R..DRN. Tcf1 RRN...R.F....K....W.....G..P.A.S.......QQ..I.......L...F...............Q...A..YE.......................R...Q...KS....P...SKEERETL...VEECnraeciqrgv.....................................spsqaqglgsnLVTEV..........R.................V..........Y..........NW.F....A.................N..R..................Rke.eaF....R..HKL. Tcf2 RRN...R.F....K....W.....G..P.A.S.......QQ..I.......L...Y...............Q...A..YD.......................R...Q...KN....P...SKEEREAL...VEECnraeclqrgv.....................................spskahglgsnLVTEV..........R.................V..........Y..........NW.F....A.................N..R..................Rke.eaF....R..QKL. Tgif1 RRR...R.G....N....L.....P..K.E.S.......VQ..I.......L...R...............D..wL..YE.......................Hr.yN...AY....P...SEQEKALL...SQQT..........................................................HLSTL..........Q.................V..........C..........NW.F....I.................N..A..................R.....R....R..LLP. Tgif2 RKR...R.G....N....L.....P..K.E.S.......VK..I.......L...R...............D..wL..YL.......................Hr.yN...AY....P...SEQEKLSL...SGQT..........................................................NLSVL..........Q.................I..........C..........NW.F....I.................N..A..................R.....R....R..LLP. Tlx2 KKP...R.T....S....F.....S..R.S.Q.......VL..E.......L...E...............R...R..FL.......................R...Q...KY....L...ASAERAAL...AKAL..........................................................RMTDA..........Q.................V..........K..........TW.F....Q.................N..R..................R.....T....K..WRR.